את הליך הזיהוי מתחילים בצילומים ולקיחת סימני זיהוי, כולל טביעות אצבע, מנשכי שיניים, אם הצילום לא מצליח. בגלל מצב הגופות משתמשים לעתים בציוד מבתי החולים. כ-40 נהגים משנעים את טביעות האצבע וסימני הזיהוי למאגרים הביומטרים השונים במדינה במקביל. הסיבה להתארכות ההליך היא שהמאגרים לא מסונכרנים, לכן יש לקחת את הקבצים להשוואה מבסיס שורה למאגרים. במשטרה חוששים מטעויות בזיהוי ולכן עובדים בהליך סדור, שמואט בשל מצבן של הגופות. במקרה אחד, קרוב משפחה התעקש לזהות גופה לפי קעקוע עליה – וחצי שעה לפני הקבורה התברר שישנה טעות בזיהוי. לפי גורמי המשטרה האחראיים, חפצים אינם אמצעי זיהוי.
כאשר יש התאמה, פועלים לשחרור הגופה. השוטרים שעובדים כאן כבר משבת ומתמודדים עם המראות הקשים זיהו ולא פעם אחת את חבריהם, שלחמו בחירוף נפש ונפלו בקרב מול המחבלים. הגופים האמונים על המלאכה הם המשטרה, צה"ל וזק"א.